São cursos que funcionam em módulos. Cada módulo é dado ao longo de uma semana e o número de módulos obrigatórios depende do programa do curso.

Os cursos modulares são direcionados para áreas específicas como Missões, Pregação, Aconselhamento, Estudos Doutorais ou Curso Bíblico de Capacitação Ministerial (que é o único curso que não exige formação superior).

Por serem modulares, tornam-se mais viáveis para alunos que residem fora de São Paulo ou que possuem dificuldades em estudar de forma regular, durante a semana ao longo dos semestres.

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